正当收复南疆八城的战役已克服东四城之际，英国又出面与清朝交涉，企图扶植阿克柏的长子伯克胡里立国称汗。左宗棠指示刘锦棠说：“我国进军南疆八城是“恢复旧疆”，“与英何涉”?要求刘锦棠等继续发动攻势，奋力猛进，急取喀什噶尔。
　　刘锦棠马不停蹄，指挥步骑兵分两路，直逼喀什噶尔城下。是夜，清军突然发动袭击，“金鼓齐鸣，马步越墙而进”，官兵分进合击，奋勇力战，一时间杀声震天，势如破竹。敌兵在城中无力抵挡，溃不成军，纷纷夺路而逃。这次战役，歼敌七八千人，生擒千余人，沦于外寇十二年的喀什噶尔，终于回到祖国的怀抱。
　　第二天黎明，清军发现白彦虎、伯克胡里已逃跑，便穷追不合，直至中俄边界，眼看着二人一伙被沙皇俄国接应收纳而去。清军乘胜追击，速战速决，连连攻克了叶尔羌和英吉沙。次年(1878年)一月，刘锦棠亲率步骑，收复了南疆名城和田。接着，立即轻骑飞驰喀什噶尔，处理善后事宜。
　　在群众的帮助下，当年勾结阿古柏入境的金相印等卖国贼，均被迅速查获，并分别被处以极刑。清军攻克南疆八城的正义之举，受到当地人们的响应和支持。
　　正如左宗棠所说：“本年官军收复托克逊后，南路各城投诚缠回相望于道，军行所至，或为向导，或随同打仗，颇为出力。克复地方应办各事，皆委缠回头目承办，数月以来，该回目等凡搜剿马贼，采办粮料柴草，侦探贼情，防守卡隘，均能督率回众办理无误，实属深明大义。”
　　维吾尔史料《伊米德史》也记载着：“没有一个城镇向皇帝陛下的大军射过一粒子弹。相反，很多城镇的好人还为皇帝的大军做了力所能及的事。”甚至连包罗杰也不得不承认，对阿古柏“有不满情绪的并不限于他的人民中的任何一部分，而是遍及全体人民之中”。
　　包罗杰在《阿古柏伯克传》中，对阿古柏失败的必然性作了如下较为公正的概括：“和中国人的权威比较起来，他的权威等于零；和中国人的坚韧比较起来，他的坚韧即是软弱；和中国人的战术比较起来，他的战术只是一个小学生的战术，甚至和中国人的勇气比较起来，他也不得不承认他的勇气遇到了一个绝不亚于他的对手。”
　　左宗棠指挥西征军，仅用一年多时间就攻克了被外寇侵占的南疆八城，收复了除伊犁以外的新疆领土，这是清朝政府对列强出奇制胜的得意之笔，也是左宗棠戎马一生中最华采的乐章。左宗棠也不无得意地说：“戎机顺迅，实史传罕见之事。”
　　左宗棠、刘锦棠率领清军西征，彻底摧毁了阿古柏侵略政权，宣布了“哲德沙尔‘外寇’汗国”的覆灭。那时，正是1878年的新年伊始。
　　西征军的胜利，在外交和军事两条战线上，挫败了英俄两国的阴谋，显示了中国军队的勇气和实力。阿古柏外寇入侵势力的失败，预示着沙俄对伊犁的侵占，一定会遭到同样的失败的命运。南疆八城的收复，也给长期陷于水火之中的各族人民，带来了又一次休养生息的机会。