我区地域辽阔，是古代"丝绸之路"的重要通道，文物古迹、遗址十分丰富，列入国家级重点保护的文物点有10处，列入自治区级保护的有152处， 经普查发现的文物点有4000余处。目前全区共有文物保护管理机构39个、其中各级文物保护管理机构27个、博物馆14个； 全区共收藏文物达6万多件，其中属于一级品的有900多件。 新中国成立以来，党和国家始终致力于保护抢救濒于毁灭的大量文物古迹，投入了巨额的资金和人力、物力，使一大批具有重要保存价值的文物古迹得以保留下来。近年来， 我区各级文物管理部门贯彻执行"保护为主、抢救第一"方针， 对部分国家级和自治区级重点文物保护单位进行了较大规模的抢救维修，其中列入国家重点抢救工程的克孜尔千佛洞维修工程从1983年开工以来，已累计投入1000多万元，完成了1～3期工程项目；吐鲁番交河故城保护维修工程由联合国教科文组织援建、日本国政府投资近百万美元，第1～2阶段工程已基本竣工。此外，对库木吐拉千佛洞、赛姆赛木千佛洞、柏孜克里克千佛洞、阿巴霍加麻扎、高昌故城、阿斯塔那古墓地、哈密回王墓、叶尔羌汗国王陵、伊犁将军府、苏里坦·苏吐克博格拉汗陵墓等一批重点文物的抢救维修工程也在加紧进行，有的已取得较大进展。1988年起进行的大规模的文物普查工作和考古发掘、考古研究工作也取得了丰硕的成果。近年来，对交河故城、楼兰、尼雅、克里雅河流域、和静县察呼沟古墓群、克孜尔千佛洞、哈密五堡古墓、苏巴什沟遗址、博乐达勒特古城、鄯善苏贝希古墓进行考古发掘，取得了大量珍贵的出土文物。文博单位先后举办了新疆石窟壁画艺术展览、中国古代版画展、新疆古尸展、新疆历史陈列、新疆民族民俗展览、康家石门子大型生殖崇拜岩画展、阿尔泰山岩画展；出版了一批高质量的考古研究成果。各级博物馆，文博单位认真贯彻中央《爱国主义教育实施纲要》，热情接待各族群众参观学习，发挥利用文物进行爱国主义教育的作用，收到了良好的社会效益。
　　据资料显示，从战国以来这里曾经生活过塞、月氏、羌、乌孙、匈奴、汉、鲜卑、柔然、吐谷浑、突厥、回鹘、吐蕃、契丹、蒙古等古代民族，至今保留着祛卢文、古和田文、古龟兹文、古焉耆文、梵文、突厥文、回鹘文、吐蕃文、契丹文等古代文字，而塔里木盆地、吐鲁番盆地、哈密绿洲等十分干燥的环境，又为古代文化遗迹提供了十分理想的自然保存条件，大到古代城镇、佛教寺院，小到绢帛纸张、点心食物以及埋在地下的三四千年的木乃伊都完好无损地保存着。
　　近几年来，随着"丝绸之路"研究的兴起，经过大量考古调查、发掘，对于欧亚大陆的政治、经济、文化、艺术等相互交流、相互促进有了进一步的明确揭示，对于伊犁河流域的乌孙文化，阿勒泰、伊犁、天山、帕米尔等地区不同类型的塞人文化，吐鲁番、昌吉地区及乌鲁木齐发现的车师及前车师文化，北疆各地以石人为代表的突厥族考古文化都有了新的突破。尤其对吐鲁番地区的古城、石窟寺、不同时期的考古文化遗址、古代墓葬进行了认真的调查及发掘。出土了近3000件珍贵文物，显示了当时的政治经济、社会文化、法律纠纷、宗教信仰。其中国内首屈一指的交河故城以及高昌故城，虽然经历了2000多年的风风雨雨，依然较完整地保存下来，成为吐鲁番千年沧桑的历史见证。新疆各地普遍发现的岩刻画，对考古学、历史学、民族学、原始宗教、原始艺术，都有重大价值，成为全世界注目的一个研究课题。天山南北不少遗址、墓葬中出土的大量彩陶，对新疆的彩陶器及其所代表的考古文化，已成为国际考古界深为关心和深入研究的一个课题。不同时期的青铜器、铁器文物等大量实物，对古代新疆的采矿、冶炼、青铜器的使用及铁器时代的出现，对我们认识古代新疆的金属器铸造，有关工艺及周围地区的关系等，都提供了第一手资料，有力补充了过去文献记录的不足。1997年，自治区有文物保护业机构78个，其中文物保护管理机构60个，职工795人。收藏文物364022件，其中一级品198件。参观观众301.1万人次，其中外宾31.2万人次。共有博物馆14座，其中自治区级1座，地市级1座，职工总数186人，收藏文物33611件，其中一级品372件。 全年举办展览和陈列24次，观众6.7万人次，其中外宾1.4万人次。自治区级文物保护单位154处，国家级保护单位14处。

　　1.自治区博物馆    新疆维吾尔自治区博物馆坐落在乌鲁木齐市阿勒泰路。1953年始建。门厅高18米，为绿色圆穹形；门厅正面、内壁、穹顶饰以纯白色石膏花饰，是一座具有鲜明维吾尔传统风格的建筑。展厅面积7800平方米，馆内收藏着新疆地区发掘采集到的历史文物、民族文物和革命文物 5万余件。常设展室有：《新疆历史文物陈列》、《新疆千佛洞壁画》、《新疆出土文物陈列》、《新疆古尸展览》、《新疆历代织品展览》、《新疆民族民俗陈列》等。

　　2.交河故城    交河故城位于吐鲁番市西10公里的雅尔乃孜沟中，为唐代文化遗存，1961年国务院公布为全国重点文物保护单位。
　　故城遗址是其昌盛时期所建之规模，城内建筑面积约22万平方米， 以一条南北长300米、宽10米的大道为轴线，把遗址分为 3个区域。大道南端和东侧各有巷口通向城外，大道两侧是高而厚的土墙，没有向街的门户。由大道分支出的纵横小巷将建筑群分割为若干区，只有小巷两侧才有院落的门户。大道北部为寺院区，规模宏大，塔群壮观。中央是一座大佛塔，上部原有塑像，现已无存。大道南部的东侧，为官署和住宅所在地，占地3000多平方米，多为地上地下双层建筑，且有宽大的阶梯通道可以上下。围墙外还有城内惟一的一处广场。据考察，宅院可能是安西都护府的治所，后为天山县衙门，系唐初所建。西侧是居民区，街巷清晰，院落分明，分布有许多手工业作坊。
　　在汉代时，交河故城为车师前国的都城， 公元450年，车师前国覆灭。唐代安西都护府最初也设在这里，后来迁至龟兹。大约在元末，交河城逐渐废弃。
　　交河故城尽管经历了2000多年的风风雨雨，但是由于这里气候极为干燥，城址又远离水源，城内的官署衙门、寺院佛塔、坊曲街道等建筑物遗址仍然较完整地保存了下来。19世纪以来，不少外国探险家到这里探险，中国考古学家黄文弼也曾多次到此考察。新中国成立后，专家学者对交河故城进行了系统调查考证，取得了可喜的研究成果。如今，这座国内首屈一指的古城遗址，已成为国内外游人向往的游览胜地。

　　3.高昌故城    高昌故城位于吐鲁番市东40余公里处的火焰山脚下，又叫"亦都护城"。
　　公元前1世纪，西汉屯田部队在此设立高昌壁，以后迭经高昌郡、高昌王国、西州、火州等变迁，曾是吐鲁番地区政治、经济、文化的中心。故城于元初毁于战火，使用了1300余年。高昌故城和交河故城一样，都是吐鲁番千年沧桑的历史见证。今天，仍可以从其高耸的城墙、深陷的护城河轮廓看出它往昔的雄风。
　　现存的故城遗址，是高昌回鹘时期在唐代高昌城的基础上改建增筑的。登高展望，高昌故城全城呈不规则正方形，部局可分为外城、内城、宫城三部分，总面积约220万平方米。外城墙基厚12米，高达11.5米，周长约5.4公里，均为夯土筑成，夯层厚8～12厘米， 间杂少量的土块，有极清晰的夹棍眼。城墙外有马道、瓮城等防御设施。西城墙有两门，北端一门保存较好。北、东两面城垣也有两个城门，但门址现已不存。南城墙有三个关口。内城居外城正中，城墙全为夯土筑成，西、南两面保存较好，周长约 3公里，其建筑年代较外城为早。宫城为长方形，居全城最北部。外城的北墙，就是宫城的北墙，内城的北墙是宫城的南墙。宫城内尚存多座夯土筑成的三四米高的殿基，夯层厚度约35～48厘米，可看出是一座高达四层的宫殿建筑遗址。内城北部有一略呈方型的小堡垒， 当地叫"可汗堡"。堡内土台上有高达15米的夯筑塔形建筑， 稍西有一座地上地下双层建筑物。外城西南角有一大型寺院，占地近 1万平方米。佛寺内据传为"唐僧讲经台"的建筑尤为引人注目。外城的东南角也有一所寺院 ， 保存有一座多边形塔和一个礼拜窟（支提窟），是城内惟一保存有较好壁画的地方。城内遗物种类繁多，其中以回鹘时期摩尼教壁画、经典、文书、佛教壁画、塑像及不同文种的文书数量最多、最著名。回鹘时期以前的遗物，唐代的居多， 但以北凉承平三年（445）沮渠安周造寺碑最负盛誉。
　　据史书记载，高昌城当时有人口3万， 僧侣3000。街道纵横，房屋栉比，商肆骈列，来往贩客不断。那不同肤色，各异服装、语言的熙熙攘攘的人流，显示出高昌当时繁荣、昌盛的太平盛世景象。当地的维吾尔族群众， 至今仍有称高昌为"亦都护库特赛里"的，意思就是"王城"， 足见其往昔的繁华、荣耀。13世纪以后，高昌故城空留下一片废墟，如今，一切早已消失在历史的烟云之中。19世纪末至20世纪初，外国探险家多人来过这里。

　　4.克孜尔千佛洞    克孜尔千佛洞位于拜城县克孜尔乡东南约7公里处， 东距库车城约60公里，北靠明屋达格山，前面有渭干河在山间蜿蜒流过，隔河屹立着雀尔达格山。在绵延数公里的沙石山壁上遍布人工凿出的石窟。石窟的形式大体有两种：一种为僧房(又称毗诃罗窟)，是供僧徒居住和坐禅用的场所，多为居室加通道结构，室内有灶炕等简单生活设施；一种是佛殿(又叫支提窟)，是供佛徒礼拜和讲经说法的地方。支提窟中有窟室高大、窟门洞开、正壁塑立佛的大像窟，有主室作长方形、内设塔柱的中心窟，有窟室为较规则的方形窟。现已编号的洞窟236个，分64个僧房，172个佛殿。这些不同类型和用途的窟，多规律地修建在一起，组合成一个个单元。从配列的情况看，每个单元可能就是一座佛寺。可以想见，当年克孜尔石窟是龟兹一处佛寺栉比、僧徒比肩的地方。
　　克孜尔石窟是龟兹石窟艺术的发祥地之一，其石窟建筑艺术、雕塑艺术和壁画艺术，在中亚和东方佛教艺术中占据极其重要的地位。
　　克孜尔石窟的雕塑多已损毁或被外劫。现存的多已残缺，但从这些塑像遗存中，仍可看出龟兹雕塑的高超技艺。石窟雕塑有石雕、木雕、浮雕、彩雕等多种形式，有佛、菩萨、天王、武士、供养人等多种形象。
　　克孜尔壁画现存1万多平方米， 占整个龟兹壁画的绝大部分。其内容主要有佛像画、佛经故事画、动物画、山水画、花树画、装饰图案画等。尤以佛经故事画为多，其中的佛本生故事画和因缘故事画的数量均为全国石窟画之最。
　　克孜尔壁画布局完整对称，人物形象逼真，色彩艳丽，表现力强。壁画造型除受中原影响的列佛和千佛壁画多以墨线勾勒外，其他人物形象都用铁线勾勒与色彩晕染相结合的手法表现。有的先用硬笔画出人体的主要部位，再用墨线勾描，质感极强，富有鲜明的地方特色。克孜尔画家首创的龟兹凸凹技法，对我国绘画艺术产生过极大影响。石窟壁画中，裸体人像艺术成就突出，显示了我国古人人体艺术的辉煌成就。
　　克孜尔石窟始凿于何时，目前尚无定论。经对石窟四壁的碳14测定，现存石窟中最早的约为公元4世纪时开凿。
　　克孜尔石窟是我国修建得较早、现存规模较大的一座石窟寺。它的特殊窟形、壁画题材和艺术风格，深刻反映了龟兹佛教的情况，代表了龟兹民族的文化艺术水准，对研究龟兹社会历史、佛教文化，以及中西关系，无不具有重要意义。
　　1961年，克孜尔石窟被列为国家第一批重点文物保护单位。

　　5.楼兰古城遗址    楼兰古城遗址位于孔雀河下游干三角洲南部，罗布泊西北岸上，西南距若羌县城220公里， 其具体位置核定为：东经89°55′22″，北纬40°29′55″。为国家重点文物保护单位。
　　楼兰名称最早见于《史记·匈奴列传》。从采集到的大量细石器标本考证，楼兰地区早在新石器时期就有人类活动，是远古居民的重要聚居点。 楼兰建立为国家，约在公元前3世纪前后，受月氏王统治。约在公元前177年至前176年间，匈奴打败了月氏，楼兰又被匈奴所统治。汉元凤四年(前77)，楼兰国更名为鄯善国，并将国都南迁至邗弥城(今若羌县城附近)。从东汉至魏晋时期，作为丝绸之路上重要交通枢纽的楼兰城，继续存在了400年左右。 约在前凉时期，楼兰古城废弃，埋没在渺无人烟的沙漠中1000多年无人知其消息。1900年的春天，瑞典人斯文·赫定在罗布泊探险，在一个偶然的机会里发现了这座迹踪难觅的古城，自此以后，外国探险家接踵而至。这些探险队在罗布泊地区发掘采掠了大量无价古文物，震惊了世界，古楼兰城从此被誉为历史遗留下来的"博物馆"， "东方的庞贝城"。
　　1922～1988年期间，我国科学工作者和考察队，多次到楼兰古城进行综合考察，揭开了楼兰地区古代文明的新的一页。这座古城基本呈现正方形，东城墙长333.5米，南城墙长329米，西、北两面城墙各长327米， 总面积108240平方米。城墙为夯筑，中土层夹芦苇或红柳枝。城内主要建筑布局即以古河道为轴线，分为东北区和西南区。东北区残存遗迹较少，最突出的是有一座九级佛塔建筑。塔身为圆柱体，现残高10.4米，用土坯夹木料垒砌而成。塔基呈正方形，每边长约19.5米。在佛塔附近尚有房屋等建筑残存。
　　西南区是古城的中心，保存遗迹亦相对较多。 正中有3间用土块垒砌的房址， 东西长12.5米， 南北宽 8.5米，总面积106.25平方米。
　　古楼兰城出土文物十分丰富，价值连城。主要出土文物除新石器时代的石斧、玉斧、石刀、石箭镞、石针、石杵等外，还有汉简、汉锦、汉文书、祛卢文书、木器、陶器、铜器、玻璃制品、铅器、铁器、金器、银器、纺织器、古钱币、漆器等。其中以晋代手抄《战国策》和汉锦最为珍贵。

　　6.阿帕克霍加墓(俗称"香妃墓")    阿帕克霍加墓坐落在喀什市北郊 5公里处的艾孜热特村，是今新疆境内规模和影响最大的伊斯兰教"霍加"(即圣人后裔)陵墓。墓主为喀什噶尔"霍加政权"国王、 白山派首领阿帕克霍加。现为国家重点文物保护单位。
　　阿帕克霍加墓也是一个具有维吾尔传统艺术特色的古建筑群，占地约30亩。陵园正门朝南，进门后是巨大的长方形庭院，由门楼和小礼拜寺、 大礼拜寺(加满)、教经堂、主墓室(拱拜孜)四大部分组成。传说葬有阿帕克霍加家族5代72人，实际只有58个坟包。
　　阿帕克霍加墓始建于1640年。起初是阿帕克霍加为其父亲--伊斯兰教的一个著名传教士玉素甫霍加修建的陵寝。据记载，此建筑最初采用的是平顶方形结构。1695年阿帕克霍加死后也葬于其间，并对玉素甫霍加原先那座简朴的墓开始进行大规模扩建。因为阿帕克霍加是一个教权与王权双兼的人物，名望大大超过了他的父亲，此墓不仅冠以他的名字，而且被后人神化。
　　"香妃墓"之称，始于清朝末年。传说香妃本名买木热·艾孜姆汗，自幼体有异香，被称为"伊帕尔汗"(香姑娘)。后被清朝皇帝选为妃子，号称容妃，俗称"香妃"。因不服京城水土病故，由124人抬运棺木，历时3年运尸回乡，安葬于阿帕克霍加墓中。现主墓室中尚存驼轿一乘，据说就是当年运尸从北京带来的。此传说流传甚广，表达了民汉各族自古以来团结友爱的良好愿望。实际上容妃死后葬于河北遵化县裕陵的妃嫔园寝中。