这里地形复杂，道路险阻，气候多变，自古至今很少有人登足前往，喀纳斯和它的名字一样十分神秘……
在湖东岸高出湖面80-90米的陡崖上还保留着数10米长、10余米高，布满冰川丁字形擦痕的羊背石……
晴天呈深蓝色；天空若有几片白云从空中飘过，湖水便显出粉红色的倒影；阴天则变为暗灰绿色；夏日晴朗炎热的天气，湖水又变为微带蓝绿的乳白色……
随着云雾的浓淡变化，光环色泽也时深时浅，时明时暗。特别使人惊异神往的则是光环的中心同时显现出峰顶和亭子的影子——佛光乍现……
从湖边谷地的林间空地到3100米雪线以下，多样的垂直自然带景观环境，为多种类型的动、植物创造了复杂的生存条件，处处有鲜花盛开令人目不暇接……
冰川地貌的遗迹
“喀纳斯”蒙语的意思是“美丽而神秘的地方”。也有人叫“哈拉斯”或“哈纳斯”，但“喀纳斯”是自治区地名委员会法定的正确译名。
这里地形复杂，道路险阻，气候多变，自古至今很少有人登足前往，因而，喀纳斯和它的名字一样十分神秘。
保护区以喀纳斯湖为中心，湖周围山体由奥陶纪和志留纪的绿泥石石英片岩、粉砂岩、石英钠长板岩等及海西宁期的云母花岗岩组成，呈阶梯状断块山，角峰、刃脊、古冰斗、u形谷、悬谷、冰碛垅、冰碛湖、泥石流阶地……仅大、小不等的高山湖泊就达500余个。
从冰川地貌可以分辨出这里较明显的出现过三次冰期，而喀纳斯湖则是由第二次冰期的巨大复合山谷冰川刨蚀而成。
当时冰川长数千米以上，冰川厚度约200－300米以上，由于缓慢而稳定的退缩，在喀纳斯湖口留下了宽约1千米，高50－70米的终碛垅，而后即迅速退缩，形成了现在喀纳斯湖的基础，至今在湖东岸高出湖面80-90米的陡崖上还保留着数10米长、10余米高，布满冰川丁字形擦痕的羊背石。
阿尔泰山的现代冰川群主要集中于该地，保护区内有冰川374条，总面积261．9平方千米，占阿尔泰山冰川总数的81％。其巾最 长的喀纳斯冰川发源于友谊峰，长10．8千米，面积31．85平方千，是喀纳斯河的主要补给水源。
在羊背石和保护区的岩洞中，还发现有古人的岩石壁画，其年代有待考古学家考证。
完整的垂直自然景观带
保护区位于阿尔泰山主峰群迎风坡上，降水量600-800多毫米，以森林带中上部为最大。由于地形强烈切割，高差很大，垂直自然景 观带在这里非常明显，往往在一个山坡卜就可饱览阿尔泰山6—7个垂直自然景观带的真貌：海拔800-1200米为山地寒带灌木草原—栗钙土带；山谷中海拔1200～1500米的向阳坡和台地是山地寒温带针叶林—灰黑土及漂灰土带，漂灰土主要分布在海拔1800米以上的阴暗针叶林巾；在森林带上部1800~2500米间呈锯齿状分布有亚高山寒冷草甸一黑毡土带；其锯齿向下为高山寒冷草甸一草毡土带；在海 拔2650~3100(3200)米之间为高山寒冻垫状植被、苔藓、地衣一冰沼土带；其上为永久冰雪和裸岩带。多样的垂直自然带景观环境，为多种类型的动、植物创造了复杂的生存条件。
变色的湖水奇观
喀纳斯湖位于保护区的中心地段，湖面海拔1374米，面积37．7平方千米，是天山上天池的11倍，最大水深188．5米。
透过湖边茂密的树林望去，层层青山云雾缭绕，顶顶“白帽”映人碧绿的湖，湖边被松、杉、桦、柳和水边没人高的草丛点缀着，湖中成群的野鸭在嬉戏，大鱼不时跃出水面，激起一片涟漪。
喀纳斯湖随着天气的变化，其水色也有规律变化：从山头望去，晴天呈深蓝色；天空若有几片白云从空中飘过，湖水便显出粉红 色的倒影；阴天则变为暗灰绿色；夏日晴朗炎热的天气，湖水又变为微带蓝绿的乳白色，这是由于冰川强烈融化带来大量的乳白色粉状 冰碛风化物所致。
每年12月份湖面封冻后，喀纳斯湖又像一面白色的水晶镜，当地蒙古族牧民就利用爬犁在湖面上运输。湖内的冰直到第二年5月才能完全消融。
喀纳斯湖位于额尔斯河水量最大的支流——布尔津河上源喀纳斯河的中段，湖口流量约50立方米/秒，隆隆的流水声不绝于耳。
湖面年变化高差约25-30厘米，湖边沼生植物非常茂密，水禽嬉戏其间。
湖上谷风占优势，将上游和湖两岸倒人湖中的树木吹向湖的北端，形成一条近百米宽、两千米长的枯朽浮木带，呈一特殊的旅游景观。
据下游30多千米的琼库勒水文站资料推算，保护区平均年径流深580毫米，年径流量48、55亿立方米，其径流深度之大在干旱区域的新疆山区域居首位。
喀纳斯佛光
提起佛光，神奇而又美丽的峨嵋山金顶佛光是人们首先想到的，但有谁知远在西域的喀纳斯湖畔，也有着同样的胜景呢！
充沛的降水，凉爽的气候，使喀纳斯湖区常常笼罩在朦朦雾霭之中，而高出云雾顶部的山峰，佛光自然出现了。
喀纳斯湖南段，湖的西面有一座骆驼峰，海拔2030米，峰顶修的“一览亭”，红柱绿顶，佛光在这里可以常常看到。
7、8月份，每当雨后的清晨，喀纳斯山区谷地往往会被浓厚的云雾遮盖，只露出一座座2000米以上的峰顶。若登上“一览亭”眺望，只见头顶碧蓝的晴空中，斜挂着一轮巨大的朝日，远近雪峰，似晶似玉，在朝阳下反射出红红的光芒。脚下的白色云海，浪涛般地随风翻滚，时而露出一块块一平如镜的蓝色湖面，时而又露出一片片绿色的林海。
那迎面而来的彩云，带着反射太阳的霞光，千姿百态，变幻无穷，使人日不暇接。上午9-10时左右，太阳升到一定高度时，在湖西山谷的云雾中，也就是与太阳的相对方向，便逐渐显现出一个半圆形的巨大的彩色光环，赤橙黄绿青蓝紫，七色俱备，鲜艳夺目，下部则没于云雾中。随着云雾的浓淡变化，光环色泽也时深时浅，时明时暗。特别使人惊异神往的则是光环的中心同时显现出峰顶和亭子的影子，以及你本人站在亭外的被放大了的巨大身影。这些山峰、亭子以及你的身影，在彩色光环的围绕衬托之下，色彩绚丽，光彩夺目，神佛欲现，飘飘欲仙的感觉油然而生。
此时的你若一时兴起，按捺不住，手之舞之、足之蹈之，那么，你在光环中的倩影也跟着手舞足蹈起来。此情此景，真的大开眼界，大饱跟福，能目睹这一奇景可谓平生一大幸事。
佛光大约可以持续一刻钟左右，随着太阳的升高和光线角度的变化便逐渐隐去，但留在心中的印象，将使你终生难忘。
天然百花植物园
6月中旬，保护区内，在高耸的碧绿色落叶松林间，一片艳红——野生赤芍的盛开了。
从湖边谷地的林间空地到3100米雪线以下，处处有鲜花盛开；橙色或黄色的金莲花、郁金香、水毛茛、报春、百合；蓝色的龙胆、飞燕草、党参、盖尾；紫色的鹿草、鸡爪、驴食豆、糙苏、翠雀花；粉色、红色的赤芍、蔷薇、柳兰、马先蒿、芽蓼、石竹……
白色的防风、野胡萝卜的伞形花像朵朵白云，高过头顶，常常淹没人们的身影，蓝天、白云、雪峰、绿色的树林和碧绿的湖水融为一体，构成异常瑰丽的图画。
本区植物种类丰富，珍稀特有种多，是我国寒带草原区植物种类最多的地区，共有植物83科，298属，798种。其中木本植物23属，66种，草本植物273种，乔木12种，灌木54种，有新疆新纪录的8种(全国新纪录亚种一种)。在66种木本植物中，国内仅阿尔泰分布的就有30种，是我国同类地区植物种最丰富的地段之一。
塔形的西伯利亚云杉、秀丽的西伯利亚落叶松是这里的主角。这里构成了保护区漫山遍野的原始阴暗针叶林。
林中枯朽倒木层层叠叠，行走困难，朽木及地表枯落叶层上长满了苔藓、鹿蹄草、越桔等，形成了林区的最下层。
蔷薇、刺毛忍冬、木旬子……构成了林区的中层。
20～30米高的乔木层，挂满松罗，多以混交林的形式出现，但因地形的变化其树种组成有异：森林带的上部常出现红松的纯林；在1700—2000米的阴坡则有时出现阴暗的冷杉纯林；河谷中多以云杉为主；而落叶松则有较强的适应性，整个森林带均可常见。
林火烧过的地方，则被柳、杨、疣枝桦所占据，在它们的掩护下，针叶林更新层在茁壮地生长。这里是西伯利亚冷杉、西伯利亚红松、小叶桦、北极柳、黄花柳等10余种珍稀树种在我国的唯一产区，有的则是阿尔泰山的特有种，西伯利亚花楸和西伯利亚接骨木也是极待保护的珍稀树种。
喀纳斯保护区是进行遗传和育种研究的一个良好的基闲库，栽培作物中的亚麻、芹菜、百合、葱、蒜、草木樨、苜蓿及某些禾本科作物等，这里均发现有其野生种。供观赏的花卉种类就更多，如赤芍、郁金香、堇菜、金莲花、筒子菊等。中草药如灵芝、沙参、黄芪、大黄、雪莲、独活、防风等有100余种。
特别是鹿根，据记载西伯利亚居民用它代替人参使用，药效仅次于东北人参，在我国只分布于该地和塔城一带。
本区的真菌种类也很丰富，初步调查有真菌99种，其中25种为新疆新纪录。其中食用菌50种，有冬虫夏草、平盖灵芝、松杉灵芝……药用真菌43种，其中具有抗癌作用的就有24种。
珍稀野生动物的乐园
无边无际稠密的原始森林和茫茫的百花草园以及众多的河流和湖泊，形成了种类繁多的野生动物生活的良好环境，喀纳斯保护区成为我国寒温带动物种类最多，数量最大的分布区。
初步考察，这里有昆虫300余种，鱼类8种，两栖及爬虫类7种，鸟类100多种，兽类35种，驼鹿、马鹿、雪豹、猞猁、紫貂、扫雪、石貂、盘羊、北山羊、天鹅、松鸡、黑琴鸡、榛鸡、雷鸟漫山遍野……多达20多种的鸟兽是我国规定的保护动物。
保护区的鸟中，普通松鸡、岩雷鸡、黑琴鸡等28个种和亚种在我国仅产于该地或是新疆的其他一些地方。
有70多种鸟类基本上均在这里繁殖育雏，甚至蒙新区其他分布区无繁殖纪录的赤颈鸭、白眼潜鸭及在树洞中作巢的鹊鸭，也是这儿的繁殖鸟。
喀纳斯的紫貂毛皮质量较东北紫貂毛皮为优，东北的养貂场常到这一地区收购活紫貂运去做种源。原始密林中还有鼯鼠活动，因其前后肢间有皮膜，能在树枝间滑翔60—70米之遥，又被称做“飞鼠”。在它们集中活动的山洞巾，可挖到“五灵脂”——鼯鼠多年的陈粪，是一种中药，其质量极优，远销全国。
由于生活环境优越，棕熊也体格硕大，形似小牛。外贸部门曾在这里收购到一张棕熊皮，竟有3.5米长，1.8米宽。
松鸡是大型鸟类，其雄鸟脖颈有环状绿色金属光泽，羽毛华丽，体重可达4千克以上，行动笨拙，飞翔距离不远，多以滑翔为主，其肉质细嫩且有松子香味。
黑琴鸡全身乌黑而耳赤，体重也可达2千克以上。它们都是培育优良鸡种的良种源。
在林间空地的湖边，常可见到阿尔泰林蛙和胎生蜥蜴。此外，在林间草地上还发现有捷蜥蜴和冰河时期留下来的极北蛙等两种毒蛇。
揭开湖怪之谜
很久很久以来，当地牧民中就流传着许多关于湖中怪物的故事：有人说，很久以前，牧主的马群在湖边饮水而突然失踪了；有人说，湖怪曾在湖面兴风作浪，发出巨大的响声，因而引起了地震；也有人说，60年前在湖边发现一条“搁浅”的鱼怪，被人分而食之，它的肉17匹马也没有驮完……这些传说离奇诱人，为美丽的喀纳斯湖又增加了几分神秘的色彩。
1985年7月下旬，新疆大学动物学教授向礼陔率领的考察队在湖边丁作时，突然发现数十条巨型鱼在湖面出现。两天后，袁国映带领的新疆环境科学研究所的考察队也在“一览亭”上观察到了湖中的巨型鱼群，并摄得了许多照片和一段录像，从而初步揭示了喀纳斯湖的鱼怪之谜。
从高出湖面660米的“一览亭”下望，在大约1千米之外的湖面上，有数十条巨型鱼分散漂浮着。它们除与体形等大的鱼偶尔互相靠近外，与其余的鱼相隔大都在数十米至百米左右，看来它们之间都相互怀有戒心，与一般鱼群表现大不一样，不敢互相靠近。从远处看来，这些巨鱼像一团团蝌蚪形的红褐色水生植物体，有的色深，有的色浅，似是离水面深浅不等所致。还有个别的鱼，巨大的嘴巴露出水面进行呼吸，激起一圈圈巨大的波纹，在10倍的望远镜中看得十分清晰。那些最大的鱼的头部，看来与湖边树顶的大小几乎不相上下，估计最大几条鱼的鱼头的宽度在1—1.5米之间，体长不少于10米，体重2－3吨以上。
在喀纳斯湖中，过去已知的鱼有哲罗鲑(大红鱼)、细鳞鲑(小红鱼)、北极茴鱼、江鳕等8种鱼类。其中哲罗鲑以肉质细嫩、美味可口而久负盛名。它是高山冷水型淡水鱼，体色红褐、口中上下颚及舌上长有倒刺，是肉食性鱼类，性情十分凶猛。我们曾在6千克重的鱼腹中，发现过两只野鸭。它的寿命很长，七八岁方性成熟，喜在上游清澈流水的砾质河底掘穴产卵，繁殖后代。这种鱼可长得很大，1984 年曾捕到一条，重达38千克。我们从观察到的巨型鱼的体型、颜色以及湖中各种鱼类的生态特性判断，这种巨型鱼无疑就是哲罗鲑，这在世界上都是很罕见的。
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